Projekty finansowane w ramach programów transgranicznych powinny sprzyjać budowie wzajemnych powiązań „ponad granicami” pomiędzy samorządami lokalnymi, instytucjami edukacyjnymi, organizacjami pozarządowymi czy też instytucjami kulturalnymi. Każdy projekt musi również wykazywać znaczący „wpływ transgraniczny”.

Programy Współpracy Transgranicznej są częścią Proogramów Europejskiej Współpracy Terytorialnej na lata 2007-2013, która zastąpiła Inicjatywę Wspólnotową Interreg III 2004-2006. Głównym celem jest promowanie współpracy i bezpośrednich kontaktów wspierających rozwój gospodarczy i społeczny oraz ochronę środowiska w obszarach przygranicznych, charakteryzujących się zwykle niższym poziomem rozwoju w porównaniu do średniej krajowej.

Projekty finansowane w ramach programów transgranicznych powinny sprzyjać budowie wzajemnych powiązań „ponad granicami” pomiędzy samorządami lokalnymi, instytucjami edukacyjnymi, organizacjami pozarządowymi czy też instytucjami kulturalnymi. Każdy projekt musi również wykazywać znaczący „wpływ transgraniczny”.

Będą one wdrażane w regionach na poziomie NUTS III, usytuowanych wzdłuż wewnętrznych i niektórych zewnętrznych granic lądowych Unii Europejskiej oraz w obszarach nadmorskich oddzielonych od siebie maksymalnie o 150 km. W Polsce współpracą transgraniczną objęte zostaną podregiony, których granice stanowią granicę państwową, a także podregiony usytuowanych wzdłuż wybrzeża Morza Bałtyckiego.

Polska będzie brała udział w programach:

• Polska (Województwo Zachodniopomorskie) – Niemcy (Meklemburgia/Pomorze Przednie - Brandenburgia)
• Polska (Województwo Lubuskie) – Niemcy (Brandenburgia)
• Polska (Województo Dolnośląskie i Lubuskie) – Niemcy (Saksonia)
• Polska – Republika Czeska  
• Polska – Republika Słowacka
• Polska – Republika Litewska
• Południowy Bałtyk (Polska - Szwecja – Dania – Litwa – Niemcy).

Polska będzie zarządzała 3 programami:

• Południowy Bałtyk (Polska - Szwecja – Dania – Litwa – Niemcy)
• Polska (Województwo Lubuskie)- Niemcy (Brandenburgia)
• Polska-Republika Słowacka

Działania realizowne w ramach programów dotyczyć będą:

• wspierania przedsiębiorczości, rozwój małych i średnich przedsiębiorstw, turystyki, kultury oraz handlu transgranicznego
• ochrony dóbr naturalnych i dóbr kultury, zapobiegania zagrożeniom naturalnym i technologicznym
• wspierania powiązań między obszarami miejskimi i wiejskimi
• poprawy dostępu do sieci transportowych, informacyjnych i komunikacyjnych
• gospodarki wodnej, gospodarowania odpadami oraz systemów energetycznych
• rozwoju i wspólnego wykorzystania infrastruktury, w szczególności w takich dziedzinach jak ochrona zdrowia, kultura i edukacja
• współpracy administracyjnej oraz integracji społeczności lokalnych poprzez realizację wspólnych działań dotyczących rynku pracy, promocji równouprawnienia (w tym równouprawnienia kobiet i mężczyzn), rozwoju zasobów ludzkich oraz wspierania sektora badawczo-rozwojowego.

Beneficjentami programu bedą:

• jednostki samorządu terytorialnego wszystkich szczebli
• podmioty i jednostki organizacyjne powoływane lub tworzone przez państwo, wojewodów lub jst w celu świadczenia usług publicznych
• pozarządowe organizacje non-profit
• izby: gospodarcze, handlowe i rzemieślnicze
• szkoły wyższe
• instytucje publiczne prowadzące działalność edukacyjną, badawczą
• instytucje kultury
• kościoły i związki wyznaniowe
• euroregiony.

Najważniejsze kryteria dotyczące projektów:

• transgraniczny charakter projektów (partnerstwo w planowaniu, zarządzaniu i realizacji programów, korzyści z realizacji projektu dla mieszkańców z drugiej strony granicy, tworzy podstaw pod trwałą współpracę transgraniczną
• zgodność z odpowiednimi priorytetami i wskaźnikami Programu
• pozytywny bądź neutralny wpływ na polityki horyzontalne ochrony środowiska naturalnego, zatrudnienie, równości szans (kobiet i mężczyzn, osób niepełnosprawnych)
• przyczynianie się do tworzenia sieci współpracy na tym terenie
• wkład w rozwój transgranicznego rynku pracy
• w każdym projekcie w ramach programów współpracy transgranicznej i transnarodowej muszą uczestniczyć partnerzy z co najmniej dwóch krajów, w tym z co najmniej jednego kraju członkowskiego UE
• wspólna realizacja (podział ról pomiędzy partnerami, wykonywanie komplementarnych działań)
• wspólny personel zatrudniony do realizacji projektu (wyznaczenie osób odpowiedzialnych za realizację poszczególnych komponentów projektu oraz wszystkich partnerów, wyznaczenie wspólnego koordynatora)
• wspólne finansowanie (wspólny budżet projektu, podział budżetu na poszczególnych partnerów, odpowiadających przewidzianym dla nich działaniom, realizowanym na rzecz wszystkich uczestników projektu).